Informacje o przetargu
usługa sekwencjonowania genomowego miRNA
Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem usługi jest otrzymanie sekwencji mRNA z 10 próbek śledziony kury (Gallus gallus) 1. Usługa składa się z dwóch integralnych części: przygotowania bibliotek z powierzonego RNA całkowitego oraz sekwencjonowania na platformie Illumina HiSeq 2500 rapid run Mode 2. Biblioteki kierunkowe przygotowane będą przez dostawcę z RNA całkowitego dostarczonego przez zamawiającego przy użyciu oryginalnego zestawu odczynników TruSeq smallRNA. 3. Koszty transportu próbek transportem lotniczym ponosi wykonawca. 4. Wykonawca dopuszcza do wysyłki próbek przy uzyciu probówek stabilizujących RNA. Alternatywnie przy uzyciu suchego lodu do 10kg masy całkowitej przesyłki. 5. Akceptowalnym materiałem wejściowym jest RNA całkowite w ilości nie mniejszej niż 3 µg wartości RIN równej lub większej 7.0 i rRNA ratio >1.0. 6. Wykonawca dokona sprawdzenia i weryfikacji wymaganych parametrów wejściowego materiału przy użyciu Bioanalyzera 2100 lub TapeStation 7. W przypadku negatywnej weryfikacji jakości próbki/próbek, wykonawca zezwala na jednokrotne dostarczenie dodatkowego materiału na swój koszt. 8. Sekwencjonowanie przeprowadzone zostanie na platformie Illuminy 2500, w trybie odczytów pojedynczych (single read format) z długością odczytów wynoszącą 50 par zasad. 9. Sekwencjonowanie obejmuje odczyt sekwencji 10 próbek z ilością danych >10 mln odczytów na próbkę. ` 10. Przynajmniej 85% zsekwencjonowanych par zasad powinno mieć jakość Q30 lub więcej. 11. Wynikom eksperymentu towarzyszyć będzie raport podsumowujący zawierający m.in.: a. Informacje na temat metody i procedury eksperymentalnej b. Informacje odnośnie analizy danych c. Zbiorcze podsumowanie eksperymentu (informacje dotyczące próbek, samego przebiegu oraz opracowanie statystyczne pozwalające na ocenę jakości sekwencjonowania i pokrycia próbek). 12. Otrzymane dane surowe poddane będą wstępnej obróbce bioinformatycznej (demultipleksingowi i usuwaniu sekwencji adapterowych) przez wykonawcę. 13. Po zakończeniu eksperymentu, dane surowe w formacie FASTQ będą udostępnione zamawiającemu poprzez dedykowany serwer FTP lub poprzez jakikolwiek inny protokół umożliwiający bezpieczny tryb dostępu. 14. Na żądanie, wykonawca dostarczy dane na nośniku (SSD, HDD, pamięć USB) dostarczonym przez zamawiającego. 15. Czas trwania usługi nie powinien przekroczyć 8 tygodni licząc od momentu pozytywnej weryfikacji próbek pod względem jakościowym i ilościowym. 16. Usługodawca gwarantuje, że wszystkie wygenerowane dane będą nieodwracalnie usunięte po maksymalnie 6 miesiącach. Dane nie będą przechowywane i absolutnie nie będą użyte na potrzeby własnych analiz. 17. W ramach usługi, usługodawca zapewnia spersonalizowany dostęp do systemu zarządzania celem weryfikacji aktualnego statusu eksperymentu. 18. W ramach usługi, zleceniodawca informowany jest na bieżąco o postępach i etapach pracy nad zleconymi próbkami poprzez regularną komunikację z laboratorium. 19. Usługa obejmuje wsparcie techniczne i opiekę techniczną nad użytkownikiem. 20. W ramach usługi, usługodawca nie będzie zlecał poszczególnych etapów eksperymetu (e.g. przygotowania biblioteki, sekwencjonowania itp.) osobnym podwykonawcom.
Adres: | Al. Partyzantów 57, 24-100 Puławy, woj. lubelskie |
---|---|
Dane kontaktowe: | email: agata.wawer@piwet.pulawy.pl tel: 818 893 000 fax: 818 862 595 |
Dane postępowania
ID postępowania: | 520494-N-2020 | ||
---|---|---|---|
Data publikacji zamówienia: | 2020-03-05 | Termin składania wniosków: | 2020-03-13 |
Rodzaj zamówienia: | usługi | Tryb& postępowania [PN]: | Przetarg nieograniczony |
Czas na realizację: | 56 dni | Wadium: | - |
Oferty uzupełniające: | TAK | Oferty częściowe: | NIE |
Oferty wariantowe: | NIE | Przewidywana licyctacja: | NIE |
Ilość części: | 1 | Kryterium ceny: | 0% |
WWW ogłoszenia: | https://piwet.ezamawiajacy.pl | Informacja dostępna pod: | https://piwet.ezamawiajacy.pl |
Okres związania ofertą: | 30 dni |
Kody CPV
73111000-3 | Laboratoryjne usługi badawcze |
Wyniki
Nazwa części | Wykonawca | Wartość |
---|---|---|
usługa sekwencjonowania genomowego miRNA | Macrogen Europe B.V. Amsterdam | 19 375,00 |
Barometr Ryzyka NadużyćRaport końcowy na temat potencjalnego ryzyka nadużyć dla wskazanej części wyniku postępowania przetargowego.
| Dane ogłoszenia o wyniku: Data udzielenia: 2020-03-24 Dotyczy cześci nr: 0 Kody CPV: 73111000 Ilość podmiotów składających się na wykonawcę: 1 Kwota oferty w PLN: 19 375,00 zł Minimalna złożona oferta: 19 375,00 zł Ilość złożonych ofert: 1 Ilość ofert odrzuconych przez zamawiającego: 0 Minimalna złożona oferta: 19 375,00 zł Maksymalna złożona oferta: 19 375,00 zł | |
OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Usługi
Zamieszczanie ogłoszenia:
Ogłoszenie dotyczy:
Zamówienie dotyczy projektu lub programu współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej
Zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych:
Numer ogłoszenia: 520494-N-2020
Ogłoszenie o zmianie ogłoszenia zostało zamieszczone w Biuletynie Zamówień Publicznych:
I. 1) NAZWA I ADRES:
Adres strony internetowej (url): https://piwet.ezamawiajacy.pl
Adres profilu nabywcy: https://piwet.ezamawiajacy.pl
I.2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Numer referencyjny
(jeżeli dotyczy):
II.2) Rodzaj zamówienia:
II.3) Krótki opis przedmiotu zamówienia
(wielkość, zakres, rodzaj i ilość dostaw, usług lub robót budowlanych lub określenie zapotrzebowania i wymagań )
a w przypadku partnerstwa innowacyjnego - określenie zapotrzebowania na innowacyjny produkt, usługę lub roboty budowlane:
II.4) Informacja o częściach zamówienia:
Zamówienie było podzielone na części:
II.5) Główny Kod CPV:
73111000-3
III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA
III.2) Ogłoszenie dotyczy zakończenia dynamicznego systemu zakupów
III.3) Informacje dodatkowe:
| |
IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA: 24/03/2020 IV.2) Całkowita wartość zamówienia Wartość bez VAT 17000.00 Waluta PLN IV.3) INFORMACJE O OFERTACH Liczba otrzymanych ofert: 1 w tym: liczba otrzymanych ofert od małych i średnich przedsiębiorstw: 1 liczba otrzymanych ofert od wykonawców z innych państw członkowskich Unii Europejskiej: 0 liczba otrzymanych ofert od wykonawców z państw niebędących członkami Unii Europejskiej: 0 liczba ofert otrzymanych drogą elektroniczną: 1 IV.4) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT: 0 IV.5) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA Zamówienie zostało udzielone wykonawcom wspólnie ubiegającym się o udzielenie: nie Nazwa wykonawcy: Macrogen Europe B.V. Email wykonawcy: Adres pocztowy: Meibergeef 31 Kod pocztowy: 11-005 Miejscowość: Amsterdam Kraj/woj.: Holandia Wykonawca jest małym/średnim przedsiębiorcą: tak Wykonawca pochodzi z innego państwa członkowskiego Unii Europejskiej: tak Wykonawca pochodzi z innego państwa nie będącego członkiem Unii Europejskiej: Skrót literowy nazwy państwa: NL nie IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY/ WARTOŚCI ZAWARTEJ UMOWY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ/KOSZTEM Cena wybranej oferty/wartość umowy 19375.50 Oferta z najniższą ceną/kosztem 19375.50 Oferta z najwyższą ceną/kosztem 19375.50 Waluta: PLN IV.7) Informacje na temat podwykonawstwa Wykonawca przewiduje powierzenie wykonania części zamówienia podwykonawcy/podwykonawcom nie Wartość lub procentowa część zamówienia, jaka zostanie powierzona podwykonawcy lub podwykonawcom: IV.8) Informacje dodatkowe: |
IV.9) UZASADNIENIE UDZIELENIA ZAMÓWIENIA W TRYBIE NEGOCJACJI BEZ OGŁOSZENIA, ZAMÓWIENIA Z WOLNEJ RĘKI ALBO ZAPYTANIA O CENĘ
IV.9.1) Podstawa prawna
IV.9.2) Uzasadnienie wyboru trybu