Dostawa odczynników chemicznych dla pracowni laboratoryjnych Leśnego Banku Genów Kostrzyca w Miłkowie.

Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem zamówienia jest zakup oraz dostawa odczynników chemicznych dla pracowni laboratoryjnych Leśnego Banku Genów Kostrzyca w Miłkowie. Przedmiot zamówienia został podzielony na cztery części zwane dalej Pakietami. PAKIET NR I: Odczynniki do obsługi aparatu do sekwencjonowania i analizy długości fragmentów Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer. Analizator czterokapilarny. 1.GeneScan 400HD ROX - 400HD ROX Size Standard Nr kat. 402985 lub równoważny. Równoważność polega na dostarczeniu standardu wielkości, który może być wykorzystany w analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, obecnie Life Technologies, rok produkcji 2007), długość kapilary 36 cm. Pojemność opakowania wystarczająca do przeprowadzenia 800 reakcji. Standard wielkości zawiera 21 wyznakowanych fragmentów, o następujących długościach [pz]: 50, 60, 90, 100, 120, 150, 160, 180, 190, 200, 220, 240, 260, 280, 290, 300, 320, 340, 360, 380, 400. 3 opakowania. Przyjęta w Pracowni Analizy DNA Leśnego Banku Genów Kostrzyca metodyka laboratoryjna wymaga porównywania elektroforogramów nowobadanych prób z próbami analizowanymi kilka lat wcześniej. Zamawiający wymaga dostawy odczynnika, który pozwoli na uzyskanie wiarygodnych wyników bez konieczności wykonywania czaso-, koszto- i pracochłonnych procedur optymalizacyjnych lub powtarzania prób przeanalizowanych w przeszłości. W związku z powyższym, w przypadku oferty na produkt równoważny wymagane jest złożenie pisemnego oświadczenia gwarantującego uzyskanie prawidłowych, powtarzalnych oraz porównywalnych wyników analizy fragmentów (produktów elektroforezy kapilarnej) uzyskanych z jego udziałem, z produktami uzyskanymi przy użyciu odczynnika oryginalnego. Zamawiający posiada aparat do sekwencjonowania i analizy długości fragmentów Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer. Konstrukcja i działanie aparatu do sekwencjonowania i analizy długości fragmentów Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer oparte są na szeregu patentów będących w posiadaniu producenta aparatu. Stosowane w bieżącej pracy laboratoryjnej odczynniki z ww. tabeli są kompatybilne z tym analizatorem genetycznym. Gwarantuje to powtarzalność wyników oraz możliwość transferu porównywalnych danych do jednostek współpracujących z LBG Kostrzyca. PAKIET NR II- Zestawy do amplifikacji fragmentów DNA metodą PCR 1. Taq PCR Core Kit (1000U) Zestaw Taq PCR Core Kit Qiagen Nr kat. 201225 lub równoważny. Równoważność polega na dostarczeniu zestawu zawierającego: dNTP- ultraczysta mieszanina zawierająca po 10mM dATP, dCTP, dGTP, dTTP; - ilość: 4x2 ml chlorek magnezu- roztwór 25mM; ilość: 4 x 1,2ml; PCR Buffer 10x - zawiera Tris-HCl, KCl, (NH4)2SO4, 15mM MgCl2; pH 8,7 przy 200C- ilość: 4 x 1,2 ml;CoralLoad PCR Buffer 10x - ilość: 4 x 1,2 ml - zawiera barwnik czerwony i żółty; Q-solution 5x - modyfikujący topnienie DNA; ilość: 4 x 2 ml polimeraza Taq DNA - rekombinowana, m. cząst. 94kDa. Stężenie wyjściowe 5uµl. Medium: 20mM Tris-HCl, 100mM KCl, 1mM DTT, 0,1mM EDTA, 0,5%(v v) Nonidet P-40, 0,5%(v v) Tween® 20, 50%(v v) glicerol; pH 8,0 przy 200C. Efektywność: 2-4kb/min przy 720C- ilość: 4x 250 jednostek; Podręcznik użytkownika w języku polskim i angielskim- 5 opakowań. Przyjęta w Pracowni Analizy DNA Leśnego Banku Genów Kostrzyca metodyka laboratoryjna wymaga porównywania elektroforogramów nowobadanych prób z próbami analizowanymi kilka lat wcześniej. Zamawiający wymaga dostawy odczynnika, który pozwoli na uzyskanie wiarygodnych wyników bez konieczności wykonywania czaso-, koszto- i pracochłonnych procedur optymalizacyjnych lub powtarzania prób przeanalizowanych w przeszłości. W związku z powyższym, w przypadku oferty na produkt równoważny wymagane jest złożenie pisemnego oświadczenia gwarantującego uzyskanie prawidłowych, powtarzalnych oraz porównywalnych wyników PCR- bez konieczności ponownej kosztochłonnej i czasochłonnej optymalizacji metod amplifikacji DNA w urządzeniu GeneAmp PCR System 9700 Applied Biosystems. PAKIET NR III - Zestawy do szybkiej izolacji DNA z tkanek i komórek roślinnych, nasion oleistych i grzybów. 1.Zestaw 250 kolumienek do izolacji DNA z tkanek i komórek roślinnych, nasion oleistych, grzybów. Zestaw 250 kolumienek do izolacji DNA z tkanek i komórek roślinnych, nasion oleistych, grzybów; Materiał wyjściowy < 100 mg tkanki roślinnej (mokrej) lub < 20 mg tkanki roślinnej (suchej);Objętość elucji - 2 x 50 µl; Pojemność wiązania - 50 µg; Czas izolacji - max. 35 min izolację; Możliwość przechowywania (do jednego roku) całego zestawu w temperaturze pokojowej; Kolumienki filtracyjne i do izolacji oznakowane w sposób umożliwiający ich rozróżnienie; Zestaw musi zawierać:dwa alternatywne bufory do lizy, jeden oparty na metodzie SDS, drugi - CTAB; bufor precypitacyjny;bufor wiążący;dwa uzupełniające się w działaniu bufory płuczące;bufor elucyjny; RNazę A w formie liofilizatu; 250 filtrów kolumienkowych do klaryfikacji lizatu; 250 kolumienek ze złożem krzemionkowym do izolacji DNA;500 probówek odbierających (2,0 ml, bez wieczka);podręcznik użytkownika w języku producenta (oryginalny) oraz w języku polskim i angielskim. Podręcznik użytkownika musi zawierać następujące treści:informację producenta o pomyślnym przetestowaniu buforów do izolacji z nasion co najmniej jednego gatunku rośliny naczyniowej;informację producenta o pomyślnym przetestowaniu buforów do izolacji z co najmniej dwóch innych tkanek dowolnych roślin naczyniowych;informację producenta o pomyślnym przetestowaniu buforu do izolacji DNA z grzybni;skład i pH buforu do elucji;informacje na temat obecności szkodliwych składników w buforach (zgodnie z międzynarodowym kodem risk phrases) oraz zalecanych środkach ostrożności (zgodnie z międzynarodowym kodem safety phrases);szczegółowy protokół izolacji z użyciem buforu SDS szczegółowy protokół izolacji z użyciem buforu CTAB;ramowe protokoły (na jednej stronie kartki, gotowe do umieszczenia przy stanowisku pracy) do izolacji z użyciem buforu SDS oraz z użyciem buforu CTAB;protokół do izolacji DNA genomowego z grzybów;listę problemów najczęściej występujących w czasie izolacji zestawem oraz zalecenia co do ich rozwiązania(tzw. troubleshooting)- 5 opakowań. PAKIET NR IV: Odczynniki chemiczne różne: 1. Żel krzemionkowy z indykatorem wilgoci bez kobaltu (np. pomarańczowym);Przeznaczenie: środek osuszający; SiO2xnH2O (masa cząsteczkowa 60,09-bezwodny);Granulacja 2-7mm;Gęstość nasypowa pomiędzy 500-800kg m3 ; Dynamiczna aktywność 40% wilgotności względnej min 20,0%. Opakowanie 1 kg (dopuszcza się inna masę jednostkową w kilku pojedynczych opakowaniach, przy zachowaniu sumarycznej masy tj. 20 kg)- 20 opakowań. 2.2-Propanol (Izopropanol) CZDA, wzór chemiczny: C3H8O; masa cząsteczkowa:60,10 g mol, postać: ciecz;, barwa: bezbarwny; zapach: alkoholowy; pH: obojętny;Temperatura topnienia: -89°C;Temperatura wrzenia: 82°C;Temperatura samozapłonu: 425°C;Temperatura zapłonu: 17°C;Gęstość: 0,78 g cm3 (20°C); Lepkość dynamiczna: 2,2 mPa*s (20°C);Ciśnienie par: 42,5 mbar (20°C); rozpuszczalność w wodzie: całkowicie rozpuszczalny pojemność opakowania 1L.- 9 opakowań. 3.Węgiel aktywny - CZDA węgiel aktywny, do zastosowania w kulturach tkankowych,wzór chemiczny: C,Ciało stałe,Kolor czarny,Bez zapachu,pH: około 6 (50 gl H2O jako zawiesina, 20°C),pojemność opakowania: 1 kg- 1 opakowań.